根据搜索结果，赣州在考研方面表现突出的学校主要有以下两所，具体分析如下：

一、综合实力较强的院校

赣南师范大学

- 学科优势：

江西省一流学科建设高校，化学学科进入ESI世界前1%，拥有化学一级学科博士学位授权点，涵盖经济学、法学、教育学等10个学科门类的硕士专业学位授权点。

- 考研特色：师范类专业突出（如化学化工、历史学），考研含金量高，且为江西省公费师范生培养基地。

- 学习环境：拥有黄金校区、章贡校区等3个校区，图书馆藏书丰富，学习氛围浓厚。

江西理工大学

- 学科实力：

工科为主，设有18个教学学院、68个本科专业，部分专业拥有博士点，尤其在有色金属、稀土矿开采领域具有省级重点优势。

- 考研优势：市区学校，学习资源丰富（如空教室、自习室），图书馆设施完善，适合理工科考生。

二、特色鲜明的院校

赣南医学院

- 专业优势：

医学类高校，拥有江西省一流学科和“十二五”重点一级学科（临床医学），临床医学专业发展良好。

- 考研方向：医学类硕士招生，分流方向多样，适合医学领域深造。

东华理工大学

- 学科定位：

省重点、卓越工程师大学，非211/985但实力强劲，考研难度相对较小。

- 综合评价：工科特色鲜明，省内认可度高，适合工科考生。

三、其他推荐院校

江西科技师范大学：非211/985院校，电子信息工程专业就业前景较好，调剂生要求较高。

江西中医药大学：中医、药学为特色，拥有19个硕士学位授予点，考研难度适中。

四、选择建议

专业导向：医学类优先考虑赣南医学院；师范类、工科考生推荐赣南师范大学和江西理工大学；特色学科（如东华理工大学的工程类）可关注其优势方向。

综合考量：考研含金量、学科实力、学习环境及个人职业规划需结合自身情况，建议实地考察或咨询在校生。

以上信息综合自多篇教育科普类文章，具体院校排名及专业设置请以官方最新招生简章为准。