分子科学与工程专业考研方向主要包括以下几类：

分子化学：

主要涉及化学反应、分子结构与性质、材料制备及应用等方面。

分子设计：

主要研究分子结构的设计及其在化学合成和材料制备中的应用。

分子工程：

主要研究分子材料的制备、性质与性能调控、工业化生产过程等问题。

分子生物学：

主要研究生物分子结构与功能、分子生物学技术应用等方面。

此外，分子科学与工程专业考研还可以选择以下方向：

化学工程：

包括单元操作、化学反应工程、传递过程、化工热力学、化工系统工程、过程动态学及控制等方面。

高分子化学与物理：

研究高分子材料的结构及化学、物理性质，设计、创制出高性能的高分子材料和制品。

化学工艺：

研究将原料经过化学反应转变为产品的方法和过程，以及实现这一转变的所有基础理论、技术手段及相关设备。

分析化学：

研究获取物质化学组成和结构信息的分析方法及相关理论的科学。

在选择考研方向时，可以根据自己的兴趣和职业规划，选择适合自己的研究方向和院校。例如，如果对化学合成和材料制备感兴趣，可以选择分子化学或分子设计方向；如果对工业生产和材料性能调控感兴趣，可以选择分子工程方向；如果对生物分子结构和功能感兴趣，可以选择分子生物学方向。同时，还可以考虑报考化学工程、高分子化学与物理、化学工艺和分析化学等方向的研究生，这些方向与分子科学工程专业有紧密的联系，能够为未来的职业发展打下坚实的基础。