分子工程考研主要涉及以下方向：

分子化学：

主要研究化学反应、分子结构与性质、材料制备及应用等方面。

分子设计：

主要研究分子结构的设计及其在化学合成和材料制备中的应用。

分子工程：

主要研究分子材料的制备、性质与性能调控、工业化生产过程等问题。

分子生物学：

主要研究生物分子结构与功能、分子生物学技术应用等方面。

建议根据个人兴趣和职业规划选择具体的研究方向，并选择在该领域有较强实力的院校进行报考。